Logo id.boatexistence.com

Bagaimana metagenomik dilakukan?

Daftar Isi:

Bagaimana metagenomik dilakukan?
Bagaimana metagenomik dilakukan?

Video: Bagaimana metagenomik dilakukan?

Video: Bagaimana metagenomik dilakukan?
Video: Bioinformatics Webinar Series #4 Metagenomics 2024, Mungkin
Anonim

Metagenomics didefinisikan sebagai analisis genetik langsung genom yang terkandung dengan sampel lingkungan Bidang awalnya dimulai dengan kloning DNA lingkungan, diikuti dengan penyaringan ekspresi fungsional [1], dan kemudian dengan cepat dilengkapi dengan sekuensing shotgun acak langsung dari DNA lingkungan [2, 3].

Bagaimana proses metagenomik?

Metagenomics melibatkan perolehan DNA dari semua mikroorganisme dalam suatu komunitas, tanpa harus mengidentifikasi semua spesies yang terlibat. Setelah gen diurutkan dan dibandingkan dengan sekuens yang teridentifikasi, fungsi dari gen tersebut dapat ditentukan.

Teknik apa yang digunakan dalam metagenomics?

Sampel komunitas mikroba dikumpulkan dari air laut, sedimen, hewan inang, atau habitat laut lainnya. Sel-sel yang terkumpul kemudian dilisiskan dan DNA diekstraksi dari lisatnya. Teknik yang memungkinkan metagenomics adalah shotgun sequencing, yang mengurutkan daerah acak DNA dengan cara yang tidak ditargetkan.

Apa 3 langkah belajar metagenomik?

Langkah dan proses metagenomics:

  1. Pengumpulan sampel:
  2. Ekstraksi DNA:
  3. Persiapan sampel:
  4. Analisis sampel:

Bagaimana metagenomik fungsional dilakukan?

Metagenomik fungsional melibatkan mengisolasi DNA dari komunitas mikroba untuk mempelajari fungsi protein yang dikodekan. Ini melibatkan kloning fragmen DNA, mengekspresikan gen dalam inang pengganti, dan skrining untuk aktivitas enzimatik.

Direkomendasikan: